לפני גיוסו לצה"ל התנדב עמר לשנת-שרות במסגרת גרעין "תנופה" של הצופים.
את שנת השרות הוא עשה באור-יהודה עם עוד חמישה חברים (אפרת חממי - מרחובות, דורית קרן מרעננה, טל אנגלר מרמת השרון, ודריה יובל  עם יוני גרוס מהרצליה) בנוסף לריכוז שבט הצופים הוא וחבריו לקומונה התנדבו לעזור לקהילה: במתנ``ס, במשמר האזרחי, במד"א...
מאז נפילתו שכבת ט` בשבט "יהודה", באור-יהודה נקראת: "גדוד עמר". גדוד זה אחראי מדי שנה על "מבצע עמר". במבצע זה חניכי הגדוד יוצאים למוסדות החינוך בעיר ולבתי העסק, מספרים על עמר ותרומתו לקהילה. הם אוספים תרומות ומחלקים אותן לחיילים המשרתים במוצבי הצפון.
מי שמניע את המבצע הם חניכי שבט הצופים באור-יהודה, הנהלת המתנ``ס המקומי, משפחת נקר, המשפחה שאימצה את עמר בשנת השרות, ואופיר נקר האח המאמץ של עמר.

כחלק מפרסום "מבצע עמר" הקימו חניכי שכבת ט` הנקראת "קורס עמר" אתר אשר מסביר על מהות המבצע, ועל כל המפעלים המתוכננים לצורך גיוס התרומות.
כתובת האתר של "מבצע עמר".

www.2all.co.il/Web/Sites3/omer2010